《民數記》中發生的瘟疫，是聖經中對瘟疫的記述最為具體和仔細的。瘟疫作為立約咒詛（利二十六25），是神因子民背約大發烈怒，主動懲罰和消滅他們的其中一個手段。《民數記》第一次明確提及瘟疫的地方，是當會眾在加低斯聽了十個探子散佈關於迦南地的壞消息，喧嚷着要回埃及之後，神幾乎要用瘟疫消滅他們和他們得地為業的權利，改立摩西為大國。最後因為摩西為會眾求情，他們才免了瘟疫之災，但十個探子則仍因為瘟疫死在上主面前（民十四37）。在這裏，神滅絕人的心意和降下瘟疫都是明顯而直接的。

在之後發生的兩次瘟疫，神對人叛逆的怒氣不再宣之於口，也不再控制瘟疫的範圍，帶來大規模的擴散和死亡。第一次瘟疫發生在可拉一黨被滅之後，會眾雖看見神用了異常的方法滅絕叛黨，確立摩西和亞倫的權柄，但他們還是叛逆領袖，向他們興師問罪。經文透過摩西的說話，側面描述神大發雷霆，原來在不知不覺間已經有瘟疫在會眾中間蔓延（十六46）。因着亞倫焚香為百姓除罪，瘟疫止息，死了一萬四千七百人。經文巧妙地用四句描述「瘟疫」的句子，表達瘟疫來得快、去得快，死人也快，象徵神的憤怒也是如此（46-49節）。

第二次瘟疫發生在什亭，對瘟疫的描述比上一次還要隱晦，死亡人數卻更高，有二萬四千人，僅次於大衞統計人口得罪神，使神降下瘟疫而死的七萬人（撒下二十四15）。《民數記》二十五章3節指以色列人行淫和敬拜巴力•比珥，使上主發烈怒，但直到後來非尼哈刺死公然帶女子行淫的領袖心利，經文才提及以色列人中間一直有瘟疫，而且因為非尼哈的行動才止住了。這樣隱晦的回溯和驚人的死亡人數，更突顯出神一直因百姓的罪而怒不可遏，但他們卻彷彿懵然不知，束手無策。

除了表達神的憤怒，瘟疫也實際影響以色列民的人口分佈。在什亭的瘟疫過去後，上主吩附摩西再次進行人口統計。統計結果顯示，在世代更替後，損失最多男丁的支派是西緬，那正是被非尼哈刺死的心利在其中作領袖的支派（二十五16）。瘟疫所致的死亡大大影響了支派的盛衰，最終決定了各支派在迦南地的分地大小。