哈巴谷書第三章是哈巴谷的禱告，以祈求復興開始，以歡欣歡呼信靠作結束。「耶和華啊，我聽見你的名聲就懼怕。耶和華啊，求你在這些年間復興你的作為。」（三2，《和》）這首詩「調用流離歌」，配以「絲弦的樂器」。「流離歌」的意思不能確定，可指詩的類別（詩七1；JPS：“psalm of supplication”），或與配樂有關。第2節是平行詩歌體，「聽見」與「懼怕」平行，「名聲」對應「作為」。參《新漢語譯本》譯文：
先知哈巴谷的祈禱，用激昂的音調。
上主啊，我聽見你的名聲；
上主啊，我畏懼你的作為。
求你在這些年間，復興你的作為；
求你在這些年間，使人明白！
你發怒的時候，求以憐憫為念。
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16至19節是信心的禱告。面對巴比倫大軍快將上來侵略，哈巴谷戰兢恐懼。他說：「我只可安靜等候災難之日來到，犯境之民上來」（三16，《和》），讀來給人的印象是無奈和無助地等候敵人來臨。但經文的意思該是剛好相反。哈巴谷祈求並等待神的審判臨到巴比倫，《新漢語譯本》譯：「然而我靜候災難日子，臨到上來侵略我們的人民。」《和合本2010》與《呂振中譯本》的翻譯類同。哈巴谷面對強敵犯境，並不坐以待斃，卻以信心等候救恩。
17-19節「雖然……然而」的一段，表達哈巴谷在逆境中信靠上主的心境。在農業社會中，農業「不發旺」、「不結果」、「不效力」、「不出糧食」、「絕了羊」、「沒有牛」，帶來是缺乏、貧困和艱苦的生活。雖然如此，先知仍可歡欣歡呼，因為他有的是上主、上主的救恩和他所賜的力量。《新漢語譯本》譯文：
雖然無花果樹不萌芽，
葡萄樹上不結果，橄欖樹的果實失收，
田地不出糧食，圈中羊群斷絕，
棚內也沒有牛羣，
但我必因上主歡欣，
因拯救我的神歡呼！主上主是我的力量，
他使我的腳像母鹿的蹄，
使我穩行在高岡。（三16-19）
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